课题组负责人

熊思东 博士

苏州大学特聘教授


熊思东教授,1987年在山西医学院获医学硕士学位,1992年在上海医科大学获医学博士学位,1994年在法国国立卫生与健康研究院完成博士后研究,1995至1998年在美国加州大学做访问学者。

熊教授主要学术兴趣为分子免疫学研究,主持国家自然科学基金重大项目、国家“十一五”和“十二五”传染病重大专项、国家863项目、国家973子课题、上海市重大项目、上海市科委重点项目、江苏省攀登计划项目、江苏省自然基金重大项目等研究,先后发表学术论文440余篇,出版专著16本,申请国家发明专利30余项。曾任上海医科大学校长助理、复旦大学研究生院副院长、复旦大学复旦学院创院院长、苏州大学副校长/校长、苏州大学生物医学研究院院长。

熊教授是江苏省督学、江苏省学位委员会委员、国务院学科评议组第六届、第七届、第八届成员、国家执业医师资格考试基础学科命审题委员会主任委员;是国家教委跨世纪优秀人才计划、上海市百人计划、上海市优秀学科带头人计划、上海市领军人才计划、江苏省双创人才计划入选者;是国家杰出青年基金获得者,享受国务院特殊津贴。曾获上海市科技进步一等奖、国家教育部科技进步一等奖、国家科技进步三等奖、国家自然科学奖三等奖、中国专利优秀奖、中国青年科技奖、全国中青年医学科技之星、香港求是杰出青年学者奖和中国免疫学会杰出学者奖。


研究方向

1、感染免疫

感染免疫是研究宿主和病原微生物相互作用的科学,研究病原微生物的免疫逃避和宿主防卫机制及其干预策略。我们聚焦柯萨奇病毒B3、乙型肝炎病毒和结核分枝杆菌这三类在我国引起重要公共健康问题的病原体进行研究;研究内容包括:动物感染模型的建立、鉴定病原体毒力因子或宿主感受器、分子病理机制研究、新型疫苗或治疗策略的设计等;旨在更好的阐述感染性疾病的致病病理机制,同时提供有效的治疗手段。

2、自身免疫

自身免疫是指机体免疫细胞识别自我构成成分而引起的对自身內源分子、细胞和组织产生的免疫反应,而由此产生的异常免疫应答则会导致自身免疫性疾病。我们聚焦临床最常见的重大难治性自身免疫“原型”疾病—系统性红斑狼疮(SLE),基于首创的可反映临床的新型SLE疾病模型,系统性研究疾病发生与维持的细胞和分子基础,挖掘临床干预新策略。


课题组成员

阮航博士,特聘教授,博导

阮航博士于2004~2011年在南京大学分别获得生物学学士学位,生态学硕士学位;2011~2014年在北京诺禾致源从事生物信息软件研发工作,接受系统计算科学专业训练;2014~2017年在复旦大学,师从华人遗传学家谷迅(Xun Gu)进行比较转录组学研究,获得生物信息学博士学位;2017~2020年在美国得州大学休斯敦健康科学中心从事博士后研究工作,聚焦于癌症多组学大数据研究,合作导师韩冷(Leng Han)教授;2020年12月加盟苏州大学生物医学研究院,任教授。

阮博士长期从事生物信息学相关多学科交叉性研究,现主要研究方向为使用遗传统计学方法和人工智能技术进行免疫相关复杂疾病转录组等多组学大数据分析,为理解相关疾病的遗传基础、分子机制和诊断治疗提供数据参考。在《Genome Medicine》,《Nature Communications》,《Nucleic Acids Research》,《Cell Reports Methods》,《 Signal Transduction and Targeted Therapy》等杂志上发表论文三十余篇,累计被引用超过2500次。

主要研究以下两类科学问题:

1. 基于人工智能技术的比较转录组学方法开发与复杂疾病应用;

2. 转录后调控和非编码RNA在复杂疾病中的作用机制预测,数据分析和数据库构建。


董春升博士,教授,博导

董春升博士于2006年获得中国科学院武汉病毒研究所微生物学博士学位。之后在美国威斯康星医学院和耶鲁医学院从事博士后研究,2011年加入苏州大学生物医学研究院担任熊思东教授课题组特聘副教授职位,2017年升职教授、博导。董春升博士的研究方向包括:1、感染免疫;2、病原体与宿主相互作用;3、病毒疫苗的研发。迄今为止已在其相关领域发表近30篇高水平研究性论文。董春升老师联系方式:chunshengdong@suda.edu.cn.

 

岳艳博士,副教授,硕导

岳艳博士于2009年获得复旦大学免疫学博士学位。2010年加入苏州大学生物医学研究院担任熊思东教授课题组讲师,2013年晋升副教授。岳艳博士的研究方向包括CVB3诱发的病毒性心肌炎的分子病理机制及防治策略研究,高效粘膜疫苗递送系统及新型抗感染疫苗的开发。迄今为止已在其相关领域发表20余篇高水平研究性论文并多次在国内国际会议上作学术报告。岳艳老师联系方式:yueyan@suda.edu.cn.

齐兴梅博士,副教授

齐兴梅博士于2011年获得东华大学生物化学与分子生物学博士学位,并于2008-2010年期间作为联合培养博士生赴加拿大Dalnhousie大学医学院学习两年,2012年加入苏州大学生物医学研究院担任能思东教授课题组讲师,2016年晋升副教授。作为负责人主持项目包括:国家自然科学基金面上项目(口服免疫无融合标签VP1蛋白纳米颗粒疫苗诱生CVB3特异性粘膜免疫应答及其预防病毒性心肌炎的作用及机制研究,31771003)、国家自然科学基金青年基金项目(新型VP1环肽疫苗诱生CVB3特异性免疫应答及其预防病毒性心肌炎的研究,31400789),近几年以第一/通讯作者身份发表多篇高质量SCI论文,包括Cell Reports. 2026; 45(2): 116979. (IF=8.1, 中科院一区Top);Advanced Functional Materials, 2024 ( IF2023 =18.5,一区TOP);Advanced Functional Materials, 2024 (IF2023 =18.5,一区TOP,Back Cover文章);Small, 2023,19(46).  ( IF2023 =13,一区TOP);MedComm.2024;5:e573.( IF2023 =10.7,Front Cover文章,一区).目前研究方向包括:1)蛛丝蛋白的表达、成丝机制及作为药物递送系统的应用研究;2)新型多肽疫苗的研发及递送,如CVB3型病毒性心肌炎,结核杆菌等。齐兴梅老师联系方式: xmqi@suda.edu.cn.



傅煜轩博士,副教授

傅煜轩博士于2018年在南京大学获医学博士学位,同年加入苏州大学IBMS熊思东教授团队开展研究工作,2020年晋升副教授、硕士生导师。主要研究方向为人类病毒与宿主相互作用,近几年聚焦于细胞外囊泡在病毒感染和传播中的作用等研究;研究工作以第一/通讯作者发表论文30余篇,包括PLoS Pathogens(一区TOP期刊,2023&2017)、Nature Communications(一区TOP期刊,2025)、Molecular Therapy(一区TOP期刊,2026&2021)、Journal of Controlled Release(一区TOP期刊,2021)和MedComm(一区TOP期刊,2023)等。主持国家自然科学基金、江苏省基础研究计划面上项目及苏州市科技发展计划项目等科研项目6项,申请国家发明专利7项,授权3项;入选姑苏创新创业领军人才计划。傅煜轩老师联系方式:fuyx@suda.edu.cn.



胡静平硕士,技术员

胡静平于2010年获得苏州大学微生物专业硕士学位。同年加入苏州大学生物医学研究院担任技术员。主要从事抗炎免疫及单克隆抗体治疗的研究。




 

近期发表的部分SCI论文

1. Wang KZ, Li LC, Li YN, Zhu X, Peng WB, Hua LX, Zhuang ZF, Yang XY, Zhu GS, Li JJ, Xiong SD, Chen GF, Qi XM: MARK2 serves as a key regulator of host antiviral immunity through GEF-H1 phosphorylation. Cell Rep. 2026, 45(2): 116979.

2. Li G, Wen Z, Xiong S. Microenvironmental β-TrCP negates amino acid transport to trigger CD8+ T cell exhaustion in human non-small cell lung cancer. Cell Rep. 2025 Jan 28;44(1):115128.

3. Mao KD, Huo FF, Wei HQ, Wang FR, Xiong SD, Fu YX: Autophagic extracellular vesicles (AEVs) are distinct from exosomes and play crucial roles in viral infections. Nat Commun. 2025, 17(1):1095.

4. Zhang C, Cao Q, Li Y, Lu J,Xiong S, Yue Y. Exosome co-delivery of a STING agonist augments immunogenicity elicited by CVB3 VP1 vaccine via promoting antigen cross-presentation of CD8+ DCs. Int J Biol Macromol. 2024 Mar;261(Pt 1):129518.

5. Qi XM, Wei GQ, Li YN, Xiong SD, Chen GF: Robust Systemic and Mucosal Immune Responses to Coxsackievirus B3 Elicited by Spider Silk Protein Based Nanovaccines via Subcutaneous Immunization. Adv Funct Mater. 2024.

6. Zheng J, Dong C, Xiong S. Mycobacterial Rv1804c binds to the PEST domain of IκBα and activates macrophage-mediated proinflammatory responses. iScience. 2024 Feb 6;27(3):109101.

7. Zhang W, Dong C, Xiong S. Mycobacterial SapM hampers host autophagy initiation for intracellular bacillary survival via dephosphorylating Raptor. iScience. 2024 Apr 5;27(5):109671.

8. Guo J, Zheng H, Xiong S. SENP6 restricts the IFN-I-induced signaling pathway and antiviral activity by deSUMOylating USP8. Cell Mol Immunol. 2024 Aug;21(8):892-904.

9. Yu H, Chen G, Li L, Wei G, Li Y, Xiong S, Qi X. Spider minor ampullate silk protein nanoparticles: an effective protein delivery system capable of enhancing systemic immune responses. MedComm (2020). 2024 Jun 15;5(7):e573.

10. Zhou M, Lin Y, Chen H, Zhao M, Zeng Y, Hu X, Tang P, Fu Y, Wei L, Han L. Brain-tumor-seeking and serpin-inhibiting outer membrane vesicles restore plasmin-mediated attacks against brain metastases. J Control Release. 2024 Nov;375:116-126.

11. Weng SH, Yang XY, Yu NN, Wang PC,Xiong SD, Ruan H: Harnessing ADAR-Mediated Site-Specific RNA Editing in Immune-Related Disease: Prediction and Therapeutic Implications.Int J Mol Sci 2024, 25(1).

12. Qi XM, Wang Y, Yu HR, Liu RF, Leppert A, Zheng ZH, Zhong XY, Jin Z, Wang H, Li XL, Wang XZ, Landreh M, Morozova-Roche LA, Johansson J, Xiong SD, Iashchishyn I, Chen GF: Spider Silk Protein Forms Amyloid-Like Nanofibrils through a Non-Nucleation-Dependent Polymerization Mechanism. Small 2023, 2304031.

13. Zhang H, Li X, Wang Y, Liu X, Guo J, Wang Z, Zhang L, Xiong S, Dong C: Genome-Wide CRISPR/Cas9 Screening Identifies That Mitochondrial Solute Carrier SLC25A23 Attenuates Type I IFN Antiviral Immunity via Interfering with MAVS Aggregation. Journal of Immunology 2023, 211(9):1406-1417.

14. Fu Y, Xiong S: Differential traits between microvesicles and exosomes in enterovirus infection. MedComm 2023, 4(5).

15. Wang J, Zheng H, Dong C, Xiong S: Human OTUD6B positively regulates type I IFN antiviral innate immune responses by deubiquitinating and stabilizing IRF3. mBio 2023,14(5): e00332-23.

16. Fu YX, Xiong S: Exosomes mediate Coxsackievirus B3 transmission and expand the viral tropism. Plos Pathog 2023, 19(1).

17. Zhao H, Wen Z, Xiong S: Activated Lymphocyte-Derived DNA Drives Glucose Metabolic Adaptation for Inducing Macrophage Inflammatory Response in Systemic Lupus Erythematosus. Cells-Basel 2023, 12(16).

18. Qin AD, Wen Z,Xiong S: Myocardial Mitochondrial DNA Drives Macrophage Inflammatory Response through STING Signaling in Coxsackievirus B3-Induced Viral Myocarditis. Cells-Basel 2023, 12(21).

19. Xu CL, Yue Y, Xiong S: Mycobacterium tuberculosis Rv0928 protein facilitates macrophage control of mycobacterium infection by promoting mitochondrial intrinsic apoptosis and ROS-mediated inflammation. Front Microbiol 2023, 14.

20. Wu YC, Yue Y, Xiong SD: Cardiac miR-19a/19b was induced and hijacked by CVB3 to facilitate virus replication via targeting viral genomic RdRp-encoding region. Antivir Res 2023, 217.

21. Fang J, Dong C,Xiong S: Mycobacterium tuberculosis Rv0790c inhibits the cellular autophagy at its early stage and facilitates mycobacterial survival. Front Cell Infect Microbiol 2022, 12:1014897.

22. Peng Z, Yue Y, Xiong S: Mycobacterial PPE36 Modulates Host Inflammation by Promoting E3 Ligase Smurf1-Mediated MyD88 Degradation. Front Immunol 2022, 13:690667.

23. Lu J, Yue Y, Xiong S: Extracellular HMGB1 augments macrophage inflammation by facilitating the endosomal accumulation of ALD-DNA via TLR2/4-mediated endocytosis. Biochim Biophys Acta Mol Basis Dis 2021, 1867(10):166184.

24. Liang M, Wang J, Wu C, Wu M, Hu J, Dai J, Ruan H, Xiong S, Dong C: Targeting matrix metalloproteinase MMP3 greatly enhances oncolytic virus mediated tumor therapy. Transl Oncol 2021, 14(12):101221.

25. Gao Y, Yue Y, Xiong S: An Albumin-Binding Domain Peptide Confers Enhanced Immunoprotection Against Viral Myocarditis by CVB3 VP1 Vaccine. Frontiers in immunology 2021, 12:666594.

26. Fu Y, Xiong S: Tagged extracellular vesicles with the RBD of the viral spike protein for delivery of antiviral agents against SARS-COV-2 infection. Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society 2021, 335:584-595. 


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